246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3304 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  96.19 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  95.85 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  95.85 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  95.85 
 
 		 303 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  94.72 
 
 		 297 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  87.93 
 
 		 303 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  75.95 
 
 		 291 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  75.95 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  75.95 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  76.29 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  33.58 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  33.58 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  33.58 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  25 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  25.1 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.08 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  29.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  29.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  29.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  29.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  29.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  29.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  35.37 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  26.98 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.71 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.47 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  29.69 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 230 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.55 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  27.59 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  30 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  33.68 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.1 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  25 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 227 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  34.57 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.87 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.27 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.83 
 
 		 461 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.87 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  33.71 
 
 		 257 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  26.83 
 
 		 225 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.73 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.02 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  27.91 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  30.23 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0297  two component transcriptional regulator  28.92 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  29.13 
 
 		 912 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32.05 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>