118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3347 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  583  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  89.05 
 
 		 284 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  88.97 
 
 		 264 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  69.61 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  69.61 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  69.26 
 
 		 284 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  69.61 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  69.26 
 
 		 284 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  69.61 
 
 		 284 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  68.66 
 
 		 302 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  68.66 
 
 		 302 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  68.66 
 
 		 284 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  69.61 
 
 		 284 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  68.66 
 
 		 284 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  68.66 
 
 		 284 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  68.66 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  68.66 
 
 		 284 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  67.96 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  38.52 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  38.52 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  36.65 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  26.35 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  29.37 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.08 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.18 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  32.54 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 		 498 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  29.49 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  28.44 
 
 		 1361 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  30.65 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1362 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  29.49 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  33.33 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.16 
 
 		 236 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  33.33 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  35.9 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0871  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.25 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0750  DNA-binding response regulator OmpR  32.05 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0993  DNA-binding response regulator OmpR  32.05 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3023  DNA-binding response regulator OmpR  32.05 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0975164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1574  DNA-binding response regulator OmpR  32.05 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4297  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4185  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.73 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  32.67 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  32.05 
 
 		 402 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0355  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 189 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279631  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.05 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0381  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 181 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.020205  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  32.97 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1663  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 135 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  32.1 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  31.11 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>