39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4051 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  99.3 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  98.24 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  98.24 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  98.24 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  96.83 
 
 		 284 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  85.87 
 
 		 302 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  85.87 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  85.87 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  85.87 
 
 		 302 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  85.87 
 
 		 302 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  85.87 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  85.87 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  85.87 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  71.73 
 
 		 284 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  69.61 
 
 		 284 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  71.86 
 
 		 264 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  33.81 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  33.81 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  33.81 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  34.28 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  30.77 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0459  regulator of pathogenicity factors  25.17 
 
 		 717 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0400  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 717 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  29.41 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 1045 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>