123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1770 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  97.73 
 
 		 284 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  88.97 
 
 		 284 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  71.48 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  71.86 
 
 		 284 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  71.86 
 
 		 284 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  71.86 
 
 		 284 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  71.86 
 
 		 284 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  71.86 
 
 		 284 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  70.72 
 
 		 284 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  69.2 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  69.2 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  69.2 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  69.2 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  69.2 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  69.2 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  69.2 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  68.7 
 
 		 284 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  43.68 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  35.88 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  35.88 
 
 		 320 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  35.5 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  35.88 
 
 		 398 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  26.69 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.69 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  33.33 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  29.11 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  33.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  29.11 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0750  DNA-binding response regulator OmpR  32.05 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0993  DNA-binding response regulator OmpR  32.05 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3023  DNA-binding response regulator OmpR  32.05 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0975164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1574  DNA-binding response regulator OmpR  32.05 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.91 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  30.69 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.87 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.8 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  27.05 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  32.63 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4297  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.63 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4185  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.63 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0515  two component transcriptional regulator  30.69 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000767404  normal  0.580599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  27.87 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0871  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.39 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  31.11 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.05 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.69 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  33.73 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 402 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  27.52 
 
 		 1361 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  31.11 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  36.14 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1663  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  26.72 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  36.14 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0271  osmolarity response regulator  31.11 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.43 
 
 		 704 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 1362 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2666  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.97 
 
 		 459 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>