167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0957 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  100 
 
 		 398 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  95.19 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  78.25 
 
 		 297 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  75.95 
 
 		 290 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  78.16 
 
 		 303 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  76.84 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  74.57 
 
 		 290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  74.57 
 
 		 290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  74.57 
 
 		 303 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 284 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  34.93 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  34.31 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  34.31 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  34.91 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  34.91 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  34.93 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  34.32 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  34.31 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  25.29 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  23.48 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.33 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  30.15 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  30.15 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  30.15 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  30.15 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  30.15 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  30.15 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  30.15 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  30.15 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  31.01 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.82 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.11 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  29.37 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  26.92 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  27.2 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  34.69 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  35.8 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  23.44 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  30.86 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.46 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0577  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 240 aa  49.3  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  25.83 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.08 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2257  two component transcriptional regulator  31.76 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512842  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  27.82 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  29.89 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  28 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.01 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  32.04 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  24 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.1 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  29.32 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.1 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2201  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.153982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  25.58 
 
 		 227 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  28.36 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 233 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 233 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  31.71 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.6 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  28.75 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  28.57 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1024  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.1 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0258  osmolarity response regulator  30.43 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>