42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5637 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  98.94 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  98.24 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  98.24 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  96.83 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  85.51 
 
 		 284 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  85.51 
 
 		 284 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  85.51 
 
 		 302 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  85.51 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  85.51 
 
 		 302 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  85.51 
 
 		 302 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  85.51 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  85.51 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  71.73 
 
 		 284 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  69.61 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  71.86 
 
 		 264 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  33.81 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  33.81 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  33.81 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  34.28 
 
 		 398 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 290 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 290 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  26.07 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  31.87 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  31.97 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.01 
 
 		 440 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 		 245 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  28.28 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0459  regulator of pathogenicity factors  25.17 
 
 		 717 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0400  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 717 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  30.43 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.56 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>