60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4051 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  51.31 
 
 		 304 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  26.35 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  26.69 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  24.82 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  24.82 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  24.82 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  24.82 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  24.82 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  24.82 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  24.47 
 
 		 284 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  24.29 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  25.29 
 
 		 398 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  25.29 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  25.29 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  25 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  25.29 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.05 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  23.97 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  24.59 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  24.59 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  24.59 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  24.59 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  24.59 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  24.59 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  24.59 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  28.69 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0908  two component transcriptional regulator  30.38 
 
 		 395 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  29.76 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  30.86 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3881  winged helix family two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04120  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  30.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.745463 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  25.81 
 
 		 222 aa  42.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  30.33 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0390  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  24.17 
 
 		 237 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0687003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>