45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2538 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  99.3 
 
 		 284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  99.65 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  99.65 
 
 		 302 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  99.3 
 
 		 302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  99.3 
 
 		 302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  99.3 
 
 		 284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  98.24 
 
 		 284 aa  567  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  86.22 
 
 		 284 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  85.87 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  85.87 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  85.51 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  85.51 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  85.51 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  85.16 
 
 		 284 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  70.32 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  68.66 
 
 		 284 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  69.2 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  35.06 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  34.32 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  34.32 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  34.31 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  34.32 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  33.95 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  33.95 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  33.95 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  24.47 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  24.47 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  32.97 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.64 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.27 
 
 		 236 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  27.34 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  28.57 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  29.82 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.34 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  31.11 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  27.42 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  27.42 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  25.2 
 
 		 912 aa  42  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>