116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4900 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  97.73 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  89.05 
 
 		 284 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  71.38 
 
 		 284 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  71.73 
 
 		 284 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  71.73 
 
 		 284 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  71.73 
 
 		 284 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  70.67 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  71.73 
 
 		 284 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  71.73 
 
 		 284 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  70.32 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  70.32 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  70.32 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  70.32 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  70.32 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  70.32 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  70.32 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  69.15 
 
 		 284 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  36.92 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  36.62 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  36.62 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  36.92 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  34.62 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.69 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  34.62 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.18 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0750  DNA-binding response regulator OmpR  33.33 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  29.11 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0993  DNA-binding response regulator OmpR  33.33 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3023  DNA-binding response regulator OmpR  33.33 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0975164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1574  DNA-binding response regulator OmpR  33.33 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 402 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  29.11 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  31.68 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  28.44 
 
 		 1361 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 1362 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  33.68 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4297  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.68 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4185  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.68 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0515  two component transcriptional regulator  31.68 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000767404  normal  0.580599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.87 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.87 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  27.05 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  30.93 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  30.61 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 127 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2666  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.97 
 
 		 459 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  31.11 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  31.11 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3280  two component transcriptional regulator  28.74 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0271  osmolarity response regulator  31.11 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4966  osmolarity response regulator  32.18 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196418 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0871  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.58 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143126  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.69 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  25.62 
 
 		 912 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>