130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0103 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  51.31 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  26.07 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  26.07 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  26.07 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  24.47 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  24.47 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  24.47 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  24.47 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  24.47 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  24.47 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  24.47 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  24.46 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  23.48 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  23.48 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  23.48 
 
 		 398 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  25.09 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  25.1 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  23.79 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  25.35 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  26.22 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.17 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.17 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.1 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 484 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  27.16 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  25.4 
 
 		 236 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  32.18 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  30.77 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  25.62 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  34.88 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2699  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 127 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1826  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.65 
 
 		 455 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.048867  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1958  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.5 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.814805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2319  DNA-binding response regulator  27.5 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  28.44 
 
 		 231 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1366  sigma-54 factor, interaction region  28.57 
 
 		 469 aa  45.8  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.72 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0908  two component transcriptional regulator  29.11 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3234  two component Fis family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 475 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3033  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.190199 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  23.81 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0175  two-component response regulator  29.11 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2122  two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00660884  normal  0.0855219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  25 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4054  response regulator receiver domain-containing protein  30.23 
 
 		 136 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.16 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  24.8 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  33.33 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  25.97 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  25.97 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3971  hypothetical protein  36.36 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  26.58 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  34.41 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2494  two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00298377  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  24.8 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  24.8 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.85 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  24.8 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  24.04 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.93 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  24.8 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  24.8 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  24.74 
 
 		 231 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.58 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1625 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  24.8 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  29.07 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.85 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  32.47 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  32.5 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1577  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.75 
 
 		 458 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  29 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>