More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2681 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  100 
 
 
273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  97.07 
 
 
273 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.99 
 
 
184 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
273 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  40.25 
 
 
265 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
298 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
263 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
280 aa  185  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
274 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
274 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
274 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
275 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
277 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
280 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
279 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.931829  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
267 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
276 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
274 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
253 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  38 
 
 
253 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 
273 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
272 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
284 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 
595 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 
595 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 
595 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 
595 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
278 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
286 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.87 
 
 
265 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 
595 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  29.23 
 
 
596 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 
595 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
252 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  28.85 
 
 
596 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  36 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  28.85 
 
 
596 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 
618 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  28.85 
 
 
596 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
602 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  35 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
602 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  29.27 
 
 
295 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.04 
 
 
250 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.92 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
253 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 
590 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
602 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  29.66 
 
 
295 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
276 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  36.41 
 
 
258 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  35 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
254 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
252 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
278 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
251 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
295 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
259 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2598  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
260 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
253 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
255 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
302 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
327 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0620  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.2 
 
 
277 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
246 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
246 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 
267 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
246 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.63 
 
 
230 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
263 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
264 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
256 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
251 aa  121  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  26.52 
 
 
568 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.44 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.44 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.44 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.04 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>