More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 668 aa  1378    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  79.52 
 
 		 669 aa  1099    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  81.44 
 
 		 668 aa  1152    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  81.89 
 
 		 668 aa  1158    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  40.68 
 
 		 641 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  40.31 
 
 		 683 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  38.74 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  37.88 
 
 		 741 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  37.39 
 
 		 642 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  37.36 
 
 		 741 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  37.21 
 
 		 741 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  35.37 
 
 		 619 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  39.25 
 
 		 689 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  38.9 
 
 		 689 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  36.36 
 
 		 754 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  36.09 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.72 
 
 		 788 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  37.25 
 
 		 680 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  34.57 
 
 		 907 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  36.32 
 
 		 748 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  35.83 
 
 		 709 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  36.26 
 
 		 646 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  39.92 
 
 		 734 aa  364  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.98 
 
 		 774 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  37.89 
 
 		 655 aa  363  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  35.6 
 
 		 731 aa  362  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 734 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  36.19 
 
 		 656 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 734 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 734 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 731 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 734 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 734 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 734 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  33.29 
 
 		 771 aa  360  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  34.85 
 
 		 755 aa  359  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  39.55 
 
 		 734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  35.04 
 
 		 756 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  38.59 
 
 		 757 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 692 aa  353  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  34.24 
 
 		 778 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  36.59 
 
 		 741 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  34.1 
 
 		 693 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  34.01 
 
 		 794 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  34.1 
 
 		 754 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  35.05 
 
 		 680 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  35.99 
 
 		 794 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  36.48 
 
 		 796 aa  347  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  35.73 
 
 		 780 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  35.29 
 
 		 697 aa  343  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  35.03 
 
 		 783 aa  343  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  34.69 
 
 		 714 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  34.63 
 
 		 730 aa  342  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  38.51 
 
 		 615 aa  343  9e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  41.58 
 
 		 609 aa  342  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  37.05 
 
 		 680 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  34.01 
 
 		 785 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  38.42 
 
 		 616 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  35.51 
 
 		 702 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  38.68 
 
 		 619 aa  340  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  33.6 
 
 		 771 aa  340  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  38.79 
 
 		 572 aa  340  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  35.76 
 
 		 678 aa  339  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  37.31 
 
 		 617 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  34.8 
 
 		 808 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  38.65 
 
 		 618 aa  339  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  37.31 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  34.91 
 
 		 680 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 792 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  37.69 
 
 		 617 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  39.28 
 
 		 617 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  36.45 
 
 		 688 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  32.55 
 
 		 741 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  36.99 
 
 		 790 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  36.5 
 
 		 767 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  39.53 
 
 		 610 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  32.4 
 
 		 741 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  34.22 
 
 		 777 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.62 
 
 		 692 aa  333  7.000000000000001e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 		 767 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  37.03 
 
 		 694 aa  330  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  32.59 
 
 		 724 aa  330  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  35.33 
 
 		 678 aa  329  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  34.04 
 
 		 678 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  33.24 
 
 		 706 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  34.85 
 
 		 725 aa  326  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  36.16 
 
 		 732 aa  326  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  34.9 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33.54 
 
 		 703 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  34.97 
 
 		 729 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  34.72 
 
 		 730 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  33.88 
 
 		 722 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  34.97 
 
 		 729 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  34.17 
 
 		 872 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.02 
 
 		 858 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.02 
 
 		 896 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.02 
 
 		 930 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  33.48 
 
 		 712 aa  319  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  34.65 
 
 		 682 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  35.25 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>