More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2004 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
236 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  65.25 
 
 
246 aa  319  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.61 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  53.09 
 
 
232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.97 
 
 
235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
605 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.65 
 
 
818 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.58 
 
 
1056 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 
649 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.46 
 
 
1022 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.67 
 
 
988 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.38 
 
 
784 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  35.93 
 
 
462 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.26 
 
 
1056 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.41 
 
 
289 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 
289 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
361 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.33 
 
 
706 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 
306 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  39.07 
 
 
706 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
371 aa  98.6  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
284 aa  98.2  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  35.48 
 
 
581 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.52 
 
 
820 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.84 
 
 
357 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
301 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  37.16 
 
 
334 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
927 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.68 
 
 
373 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
392 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  36 
 
 
269 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 
308 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  38.89 
 
 
539 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
1827 aa  93.2  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  36.3 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  38 
 
 
280 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.06 
 
 
582 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
543 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
617 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
3145 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
3560 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
290 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
292 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  29.79 
 
 
306 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.58 
 
 
406 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.58 
 
 
406 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
422 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.82 
 
 
623 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 
810 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  35.62 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.39 
 
 
632 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.48 
 
 
746 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 
391 aa  86.3  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 
352 aa  85.9  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
1192 aa  85.5  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.55 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  30.5 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.46 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.74 
 
 
738 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  32.77 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 
542 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 
750 aa  82.8  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
878 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.78 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
547 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
1276 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
318 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.63 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
594 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.46 
 
 
715 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
543 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
699 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
743 aa  80.1  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 
4489 aa  79.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.82 
 
 
836 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
1421 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.67 
 
 
576 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
4079 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
3035 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>