More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2924 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  100 
 
 		 399 aa  799    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  64.09 
 
 		 401 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  59.3 
 
 		 398 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  56.78 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.35 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  50.52 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.43 
 
 		 423 aa  186  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  36.14 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  36.71 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  27.76 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  28.62 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  27.67 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  28.86 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  27.25 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  27.22 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  26.28 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.73 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  25.65 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  24.93 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  26.77 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  31.41 
 
 		 416 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  28.15 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.22 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  25.7 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.11 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.36 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  27.65 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.07 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.3 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  26.98 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  25.99 
 
 		 447 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  25.99 
 
 		 447 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  31.17 
 
 		 263 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.38 
 
 		 412 aa  86.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  28.52 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  29.08 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1935  septum site-determining protein MinD  28.11 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3342  septum site-determining protein MinD  27.92 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  23.33 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.49 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.97 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.25 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  23.51 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  27.31 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  27.65 
 
 		 269 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  24.49 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.96 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  27.04 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  28.03 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1590  septum site-determining protein MinD  27.44 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.17933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1733  septum site-determining protein MinD  27.17 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.270038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  26.14 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  26.91 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1546  septum site-determining protein MinD  27.41 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1283  septum site-determining protein MinD  27.17 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  26.56 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1837  septum site-determining protein MinD  25.3 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3986  septum site-determining protein MinD  27.17 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346846  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  27.71 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25.88 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.36 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.54 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.42 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.54 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  26.22 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  27.65 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  27.65 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  27.65 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004087  septum site-determining protein MinD  25.93 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000729512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1066  septum site-determining protein MinD (cell division inhibitor MinD)  25.46 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  26.4 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  27.31 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.07 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0445  septum site-determining protein MinD  26.52 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.103592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  28.23 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1689  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  26.1 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1688  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  26.1 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2235  cell division inhibitor MinD  27.27 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000561907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  26.51 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1931  septum site-determining protein MinD  27.31 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000172441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  26.13 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  27.31 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1078  septum site-determining protein MinD  26.29 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000761328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  26.89 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3873  septum site-determining protein MinD  27.71 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.748671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1612  septum site-determining protein MinD  26.89 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00643531  normal  0.221579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1736  septum site-determining protein MinD  26.91 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01384  septum formation inhibitor-activating ATPase  25.56 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>