More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0035 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
264 aa  526  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
256 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
256 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
256 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  32.05 
 
 
254 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.44 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
264 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  32.18 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.27 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.27 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.27 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.27 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.4 
 
 
256 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  30.89 
 
 
252 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 
257 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  30.23 
 
 
257 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.91 
 
 
254 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.91 
 
 
254 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.91 
 
 
254 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  32.3 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  30.53 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  30.53 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  30.12 
 
 
252 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  30.12 
 
 
252 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  30.12 
 
 
252 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
252 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  30.12 
 
 
252 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  30.12 
 
 
252 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  30.12 
 
 
252 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  30.12 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  30.12 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.01 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  30.36 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  28.96 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
240 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  30.65 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.65 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  30.65 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.65 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.65 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.65 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  28.74 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  30.49 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 
248 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.27 
 
 
257 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  36.14 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.12 
 
 
254 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
254 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
241 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
264 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.27 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
266 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  27.1 
 
 
261 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  27.15 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  27.1 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  26.34 
 
 
261 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  26.34 
 
 
261 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  26.34 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.12 
 
 
257 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  26.67 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  27.59 
 
 
254 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  26.62 
 
 
263 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  30.31 
 
 
252 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
253 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  28.29 
 
 
262 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  25.86 
 
 
263 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  23.89 
 
 
251 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  34.14 
 
 
255 aa  105  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
252 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2986  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
260 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  25.48 
 
 
255 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.07 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  27.07 
 
 
252 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  26.92 
 
 
275 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  26.42 
 
 
268 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  27.07 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 
255 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>