More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2986 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2986  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247134  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2456  DeoR family transcriptional regulator  63.97 
 
 		 262 aa  306  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  42.08 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  40.59 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.27 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  32.27 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  36.22 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.81 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.81 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.81 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.81 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.81 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.81 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  31.05 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.2 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 242 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  32.07 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  34.25 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  34.25 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 250 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 		 250 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.14 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  29.08 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  30.87 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  36.68 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.06 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2907  DeoR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  34.41 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  34.01 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  29.37 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  29.27 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  36.99 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  32.78 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  34.18 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  35.42 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  28.34 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  33.33 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.15 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  31.35 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  31.25 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>