More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0057 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  100 
 
 		 414 aa  801    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  63.09 
 
 		 247 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  57.51 
 
 		 236 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  54.51 
 
 		 237 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  56.71 
 
 		 243 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  55.41 
 
 		 238 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  54.98 
 
 		 238 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 244 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 241 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 241 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 241 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  45.42 
 
 		 241 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 241 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 241 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 241 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  45.57 
 
 		 241 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  45.57 
 
 		 241 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 		 241 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 252 aa  222  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  45.96 
 
 		 242 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 238 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  45.57 
 
 		 240 aa  216  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  41.28 
 
 		 241 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  41.88 
 
 		 250 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 241 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  42.98 
 
 		 239 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  41.08 
 
 		 259 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  41.77 
 
 		 249 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 		 243 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40.25 
 
 		 257 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 		 244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  39.27 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  39.27 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  38.78 
 
 		 247 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  36.29 
 
 		 245 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  41.03 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  37.45 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 247 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  35.25 
 
 		 259 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  38.94 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.87 
 
 		 247 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  38.4 
 
 		 256 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 250 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 253 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  39.33 
 
 		 255 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  37.45 
 
 		 250 aa  166  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  36.18 
 
 		 253 aa  166  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 255 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  34.58 
 
 		 272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.09 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  36.78 
 
 		 249 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 272 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  35.17 
 
 		 259 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  34.12 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  36.51 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  33.79 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 261 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.78 
 
 		 312 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 301 aa  159  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 295 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.26 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.62 
 
 		 328 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  36.84 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  35.77 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.59 
 
 		 309 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 249 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  38.26 
 
 		 253 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  31.89 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  35.63 
 
 		 254 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  30.56 
 
 		 340 aa  156  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  35.83 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  33.73 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 266 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  34.53 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  36.36 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  36.94 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  34.17 
 
 		 279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  32.43 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 321 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  34.43 
 
 		 261 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  35.34 
 
 		 266 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  35.17 
 
 		 304 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  36 
 
 		 315 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  33.61 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  33.79 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  32.41 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.68 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.05 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.14 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 242 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  35.51 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 254 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 318 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 		 318 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>