More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6774 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  79.09 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  71.03 
 
 		 277 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  75 
 
 		 145 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  61.74 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  59.82 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  68.52 
 
 		 325 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  67.62 
 
 		 233 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  65.74 
 
 		 175 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  61.32 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 182 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 191 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  64.22 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 191 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  56.52 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  58.93 
 
 		 183 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  55.12 
 
 		 165 aa  123  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  52.99 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  39.32 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  38.03 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.66 
 
 		 255 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  39.39 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 252 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 		 223 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 196 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 236 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  44.64 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 250 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  45 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  45 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  40 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  40 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  40 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  40 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>