More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3547 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  743    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  54.6 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  55.44 
 
 		 409 aa  345  6e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  51.15 
 
 		 414 aa  329  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  50.39 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  53.45 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 		 408 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 		 420 aa  318  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  51.6 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  50.7 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  54.18 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  52.86 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  50.79 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  53.46 
 
 		 392 aa  310  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  51.6 
 
 		 416 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  48.29 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  49.21 
 
 		 382 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  46.46 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  47.93 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  54.28 
 
 		 409 aa  292  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  50.54 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  45.79 
 
 		 430 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 		 408 aa  282  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  46.27 
 
 		 394 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 405 aa  275  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 412 aa  275  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  43.22 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  43.22 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  43.22 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  43.22 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  43.22 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  43.7 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  44.68 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 389 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 389 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 407 aa  262  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 390 aa  258  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 411 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  46.79 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  42.94 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 388 aa  252  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  41.14 
 
 		 367 aa  252  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 391 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  44.2 
 
 		 471 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 411 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 411 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  41.79 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.33 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 400 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>