More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1755 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
538 aa  1034    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
542 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41 
 
 
542 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  49.34 
 
 
545 aa  306  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.96 
 
 
545 aa  306  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  41.59 
 
 
540 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.73 
 
 
546 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  53.43 
 
 
518 aa  292  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  52.48 
 
 
540 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.36 
 
 
547 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.49 
 
 
522 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.37 
 
 
532 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.85 
 
 
538 aa  276  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  41.24 
 
 
538 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.55 
 
 
538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.71 
 
 
528 aa  269  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  50.15 
 
 
531 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.06 
 
 
544 aa  267  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  40.18 
 
 
533 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.34 
 
 
535 aa  266  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.23 
 
 
904 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.03 
 
 
523 aa  263  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  49.41 
 
 
562 aa  262  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 
545 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  45.52 
 
 
543 aa  261  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  48.08 
 
 
347 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  52.53 
 
 
540 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 
535 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  51.04 
 
 
530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.55 
 
 
535 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
1150 aa  253  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.82 
 
 
538 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.27 
 
 
537 aa  251  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.36 
 
 
858 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
394 aa  247  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  52.16 
 
 
533 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  39.67 
 
 
540 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 
535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 
623 aa  238  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
531 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
702 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.15 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 
407 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.58 
 
 
529 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 
715 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 
526 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.2 
 
 
539 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.08 
 
 
544 aa  225  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.26 
 
 
530 aa  223  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
524 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
657 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.59 
 
 
397 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
554 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.03 
 
 
561 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  36.93 
 
 
583 aa  203  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 
741 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 
562 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.69 
 
 
533 aa  200  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 
714 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
686 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 
515 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 
562 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
573 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 
731 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
538 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  35.48 
 
 
565 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.53 
 
 
561 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 
567 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  37.3 
 
 
565 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 
602 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
688 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
656 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 
561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 
730 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 
688 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 
655 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  37.5 
 
 
565 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 
688 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 
688 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 
563 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
563 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 
573 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20550  methyl-accepting chemotaxis protein  41.3 
 
 
733 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375054  normal  0.44591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 
656 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 
561 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 
563 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 
563 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
568 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.94 
 
 
716 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 
669 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
566 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 
563 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 
538 aa  186  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  54.89 
 
 
965 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>