More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1035 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 477 aa  927    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  44.03 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  41.24 
 
 		 521 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  38.86 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  38.79 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 492 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 497 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 		 485 aa  97.8  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 504 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 506 aa  93.2  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  26.05 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 474 aa  90.5  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 455 aa  90.5  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  22.43 
 
 		 465 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.71 
 
 		 466 aa  87.4  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 468 aa  87  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 526 aa  86.7  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 538 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.73 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  25.89 
 
 		 542 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  28.62 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.06 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 513 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  27.32 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  22.65 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.9 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.79 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  24.85 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  26.39 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  25.91 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.73 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  28.66 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.66 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  23.36 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  25.34 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>