More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1955 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  62.27 
 
 		 222 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.82 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.89 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 217 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.29 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.32 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.63 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.46 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.32 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.6 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.34 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.26 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.18 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.38 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.88 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.04 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  95.5  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.37 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.09 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.47 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  28.02 
 
 		 267 aa  94.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.15 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.27 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  32.2 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.44 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.44 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  30.7 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.78 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.48 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1859  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.54 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  30.09 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.5 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  31.25 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.37 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  30.89 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.02 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.92 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  27.51 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.7 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  28.02 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.88 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1708  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.31 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.8 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>