More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1267 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  55.09 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  43.04 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 262 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 262 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  34.08 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 396 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 222 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.99 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  34.2 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>