More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4483 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  100 
 
 
737 aa  1509  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  2.31942e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.4 
 
 
646 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.08252e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 
634 aa  180  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.11979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 
642 aa  177  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.11 
 
 
638 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.68 
 
 
623 aa  168  3e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 
613 aa  168  3e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 
682 aa  164  4e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 
673 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 
655 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 
662 aa  157  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 
659 aa  157  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 
656 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  25.68 
 
 
671 aa  154  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 
692 aa  151  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 
695 aa  150  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
618 aa  147  8e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 
625 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  4.59108e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
714 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
680 aa  144  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 
602 aa  143  1e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 
628 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.96 
 
 
634 aa  137  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
620 aa  134  4e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  25.18 
 
 
671 aa  133  1e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
690 aa  132  2e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 
627 aa  130  1e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 
747 aa  130  1e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 
645 aa  128  4e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 
641 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.17 
 
 
628 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.54 
 
 
630 aa  125  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.68 
 
 
616 aa  123  1e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.41 
 
 
1023 aa  122  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 
647 aa  122  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
635 aa  120  8e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
641 aa  120  1e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.49 
 
 
661 aa  119  2e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
640 aa  119  2e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 
619 aa  117  1e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  25.12 
 
 
623 aa  115  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
634 aa  115  4e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.09 
 
 
616 aa  112  2e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 
739 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  24.92 
 
 
623 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 
754 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  21.69 
 
 
597 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 
639 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
627 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
709 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 
678 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
632 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 
613 aa  105  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  25.98 
 
 
621 aa  105  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.97 
 
 
614 aa  104  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.01627e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.32 
 
 
614 aa  104  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 
629 aa  104  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.82 
 
 
614 aa  103  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.72 
 
 
614 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.82 
 
 
614 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.82 
 
 
614 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.62 
 
 
680 aa  103  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
698 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.42 
 
 
613 aa  101  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 
614 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.27 
 
 
685 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
638 aa  98.6  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.12 
 
 
685 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.27 
 
 
821 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.52 
 
 
633 aa  98.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.58389e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.96 
 
 
685 aa  97.8  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.96 
 
 
685 aa  97.8  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.96 
 
 
685 aa  97.8  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.5 
 
 
680 aa  97.4  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.96 
 
 
685 aa  96.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 
626 aa  95.5  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 
612 aa  95.9  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  21.6 
 
 
618 aa  95.1  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 
626 aa  94.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  23.05 
 
 
617 aa  94.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  24.73 
 
 
631 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  22.41 
 
 
645 aa  93.6  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.16 
 
 
655 aa  93.2  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.72 
 
 
639 aa  92.8  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 
593 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.69 
 
 
653 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 
615 aa  92.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 
632 aa  92  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 
624 aa  91.3  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25.53 
 
 
788 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  22.82 
 
 
651 aa  90.1  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.96 
 
 
676 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 
637 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
866 aa  88.6  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
698 aa  88.2  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25.21 
 
 
750 aa  87.8  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.88 
 
 
631 aa  87.8  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  22.86 
 
 
593 aa  87  1e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
627 aa  87  1e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.88 
 
 
631 aa  85.9  2e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>