More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13141 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  100 
 
 
353 aa  689  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  96.32 
 
 
353 aa  667  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  97.45 
 
 
353 aa  672  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  84.14 
 
 
353 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  47.97 
 
 
357 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  47.75 
 
 
357 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  46.3 
 
 
356 aa  313  3e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  41 
 
 
392 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  43.71 
 
 
388 aa  279  5e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  40 
 
 
417 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 
432 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  33.09 
 
 
450 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.7 
 
 
487 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.7 
 
 
487 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 
504 aa  140  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  38.17 
 
 
489 aa  141  2e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 
490 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  35.21 
 
 
500 aa  137  3e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  29.77 
 
 
517 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.11 
 
 
400 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 
416 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  27.86 
 
 
394 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  26.56 
 
 
353 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  24.75 
 
 
366 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 
326 aa  99.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  27.03 
 
 
324 aa  99.4  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 
322 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 
409 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  24.17 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 
397 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  2.97953e-07 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  24.56 
 
 
368 aa  96.3  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  25.87 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.57 
 
 
380 aa  95.9  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 
311 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.87759e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 
383 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  26.23 
 
 
393 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  25.59 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.32 
 
 
404 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  23.06 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  25.17 
 
 
338 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.86 
 
 
366 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 
354 aa  94  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 
419 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  23.89 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 
354 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.43 
 
 
351 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  23.59 
 
 
348 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1676  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.47 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.35 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4493  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.29 
 
 
405 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  23.19 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  21.02 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
359 aa  90.5  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  23.84 
 
 
432 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  24.34 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.9 
 
 
366 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  20.68 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  20.68 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  20.68 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  23.74 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  23.95 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  23.91 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  20.68 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  20.68 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  20.68 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  20.68 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 
358 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 
358 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  22.56 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  23.49 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  26.18 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  22.65 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  24.4 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  23.71 
 
 
417 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  23.31 
 
 
509 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  22.86 
 
 
368 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24.5 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  21.81 
 
 
367 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  24.25 
 
 
405 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  21.81 
 
 
367 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  21.53 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.73 
 
 
405 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  24.28 
 
 
377 aa  86.3  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.33 
 
 
405 aa  84.7  2e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.43 
 
 
374 aa  84.7  2e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  22.37 
 
 
360 aa  84.7  2e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  22.71 
 
 
360 aa  85.1  2e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>