112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0235 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 
126 aa  254  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515484  normal  0.151853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0710  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 
126 aa  254  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0630  flagellar hook-basal body complex protein FliE  98.41 
 
 
126 aa  250  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.94 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  52.94 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0222  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.22 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.75 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  44.95 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.05 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  50.75 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.38 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3383  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.23 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.409901  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0170  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.2 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4418  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  54.84 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.376569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0249  lateral flagellar basal body component protein LfiE  41.23 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.5 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  43.24 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  43.24 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3566  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.48 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.38 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.45 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.79 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.15 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.53 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  41.28 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.44 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.01 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.05 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  46.67 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.01 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  39.45 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  39.45 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  39.45 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.02 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.01 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.42 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  45.83 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.86 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.78 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.27 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  41.86 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.29 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.83 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.83 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  42.31 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.86 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.27 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.79 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  48.57 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.12 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.91 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.91 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.91 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.91 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  41.79 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  40.91 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  36.71 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.91 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.54 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  40.24 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.18 
 
 
120 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  36.84 
 
 
104 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.51 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.81 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  35.9 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  44.93 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.13 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.24 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.03 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.82 
 
 
108 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  41.18 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  38.1 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.41 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.9 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  36.36 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  36.71 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  36.71 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.29 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  33.82 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.82 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.82 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  38.24 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.29 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.82 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.82 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  36.49 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  32.56 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  32.56 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  32.56 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.51 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>