169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1015 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 		 122 aa  242  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  65 
 
 		 110 aa  146  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.28 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.28 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  62.79 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  54.81 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  50 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1485  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.95 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2673  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.26 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  48.24 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  47.06 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  47.78 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  38.68 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.24 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.81 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.23 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.23 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.01 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.24 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.35 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  37.23 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  37.8 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.84 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  40.45 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.36 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  40.45 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.84 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.61 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.84 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.84 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.15 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  39.02 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.11 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  39.78 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.1 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.38 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.05 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.05 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  39.19 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.51 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.17 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  42.17 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.33 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.01 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  43.37 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.48 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  42.17 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.34 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  35.64 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  37.62 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.65 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0418  flagellar hook-basal body complex protein  50 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0984144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.43 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.62 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  36.08 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  46.48 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  35.62 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.82 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  34.88 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3282  flagellar hook-basal body complex protein FliE, putative  50 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.556445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2947  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2141  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0223  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3399  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  35.05 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.29 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.81 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.38 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.58 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.65 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  35.63 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.64 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  36.96 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  38.1 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>