63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0222 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0222  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 
110 aa  213  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0170  flagellar hook-basal body complex protein FliE  92.73 
 
 
110 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4418  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.75 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.376569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3566  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.75 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.31 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.22 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515484  normal  0.151853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0710  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.22 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0630  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.22 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3383  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.87 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.409901  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.14 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0249  lateral flagellar basal body component protein LfiE  46.15 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  37.21 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.71 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.86 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  39.53 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  37.33 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.47 
 
 
118 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  39.47 
 
 
111 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.47 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  35.56 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.67 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.79 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  35.53 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  35.53 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.11 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  31.96 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  31.96 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  31.96 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.31 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.87 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.75 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.75 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  32.41 
 
 
107 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.94 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  29.35 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.68 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.44 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  32.86 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0037  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512398  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.43 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  29.63 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.63 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.22 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.67 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.28 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  31.86 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.14 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  29.63 
 
 
105 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.36 
 
 
111 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.73 
 
 
102 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.5 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.53 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.41 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  26.67 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>