179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0425 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
110 aa  219  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.94 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.54 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  43.42 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  39.47 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  38.14 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.65 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.76 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.03 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3566  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.71 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.56 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  38.75 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.96 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.96 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.96 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.96 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.93 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.56 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.93 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.77 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.96 
 
 
112 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  37.08 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.62 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.35 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0630  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.21 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.24 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  33.64 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.07 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.62 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0710  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.79 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113201  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  38.03 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.68 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.79 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515484  normal  0.151853 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.88 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.24 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  48.68 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  33.67 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  33.67 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.48 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  40.66 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.66 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.56 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.94 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  29.35 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0170  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.68 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.11 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  39.56 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.66 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.29 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  39.56 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  39.56 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
97 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0249  lateral flagellar basal body component protein LfiE  36.49 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  42.03 
 
 
121 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.83 
 
 
96 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  33.8 
 
 
95 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.41 
 
 
98 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  37.08 
 
 
109 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
104 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  32.32 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.29 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3383  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.77 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.409901  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.75 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.07 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  37.08 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.49 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  38.46 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  53.49 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.49 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.37 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.43 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0222  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.11 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.95 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>