162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1766 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
102 aa  207  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.11 
 
 
96 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.46 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.32 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  41.57 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  47.95 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.1 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  43.59 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.24 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.14 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  41.1 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  43.84 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.12 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  38.57 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  38.57 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.36 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.76 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.03 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.29 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.37 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.37 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.26 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  33.71 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.27 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.16 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.43 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  34.74 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.86 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  32.95 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  32.95 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  30.34 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  37.31 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  39.73 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  37.31 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.82 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.12 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.87 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  35.21 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 
96 aa  52  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.89 
 
 
145 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.31 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  29.73 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.5 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.85 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  30.67 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.93 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.5 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  29.85 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.51 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  27.63 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  26.53 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.58 
 
 
117 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.5 
 
 
110 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  30.26 
 
 
111 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  30.26 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.36 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.36 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  30.56 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.36 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.85 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.08 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  32.93 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.25 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.67 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  26.04 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  27.27 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.72 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.5 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  27.59 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.17 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  28.95 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.88 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  31.11 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.58 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0840  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.03 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.96 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.57 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>