116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2572 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 		 107 aa  211  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  47.19 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.69 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.33 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.33 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.56 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  45.28 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.42 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  53.52 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  41.58 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  39 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  45.78 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  39.6 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  38.24 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  35.85 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  38.83 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.44 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.95 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  38.64 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  36.19 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  36.45 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.28 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.68 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  38.95 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  38.1 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.73 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.58 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.25 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.25 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.78 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.25 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.95 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.57 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  33.68 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  36.54 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.18 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  29.03 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.18 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  44.26 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  35.29 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  35.14 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.51 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  32.26 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.01 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  25.93 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.79 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  32.63 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  35.21 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  32.58 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  35.21 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  35.21 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.53 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  36.36 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  36.36 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  41.46 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  35.53 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  35.53 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  32.14 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  28.28 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.32 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  28.28 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.16 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.58 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  30.26 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.41 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.58 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  31.31 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.56 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  22.89 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.88 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  27.38 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.38 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  28.17 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 94 aa  42  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  22.89 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.42 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  25.71 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  27.96 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  21.5 
 
 		 112 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.04 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>