78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1368 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
102 aa  200  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.24 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  51.96 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  38.24 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  38.83 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  46.58 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  35.92 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.38 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.35 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  36.94 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.93 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.83 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.93 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  37.97 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.93 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  46.05 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  42.7 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.68 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  44.74 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.58 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.28 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.98 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.43 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  42.03 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.43 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.43 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.14 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  36.14 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  32.35 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  33.68 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.68 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  33.68 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
124 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  35.96 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.3 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.88 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  32.69 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  32 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.23 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.1 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  36.36 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  31.73 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.29 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  26.55 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.18 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.34 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  32.47 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  32.81 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  29.41 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  32.97 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  32.97 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  26.26 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  32.97 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.58 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
106 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.59 
 
 
120 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  40.48 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  26.26 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.18 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.9 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  32.5 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.67 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  31.65 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.14 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
100 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.67 
 
 
107 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>