48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4196 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 95 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  60 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  56 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  56 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  55 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  55.1 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.39 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  41.79 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  39.74 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  39.39 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  38.82 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  34.34 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.02 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.12 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  34.85 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  35.29 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.67 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.67 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  43.28 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.75 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.08 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  30.53 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.58 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.94 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  29.47 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.39 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.71 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.8 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.71 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  26.32 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.74 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  28.42 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  34.15 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.18 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.65 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.65 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.82 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.9 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.71 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.71 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.48 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.45 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.44 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.48 
 
 		 100 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>