76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2824 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 106 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  40.4 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  41 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  39.42 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  46.58 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  45.83 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  41.18 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.41 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.72 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.65 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.93 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.93 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.43 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  44.86 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  34.34 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.03 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  40.28 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  45.95 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.18 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.21 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  58.49 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  44.58 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  58.49 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  39.74 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  42.5 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  43.37 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.13 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  49.23 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.03 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.5 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  38.16 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  41.1 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  54.55 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  48.08 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  36.84 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  36.84 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  48.08 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  31.19 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  31.19 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  49.15 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  32.63 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  30.86 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  39.24 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.73 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  37.14 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  32.43 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  32.89 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  36.71 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  35.8 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  35.8 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.62 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  31.08 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  35.8 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.65 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.39 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.35 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.94 
 
 		 120 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.58 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  31.08 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.76 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.5 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  33.78 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.67 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.29 
 
 		 104 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>