162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2574 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
104 aa  207  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  95.19 
 
 
104 aa  200  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  74.04 
 
 
103 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  74.04 
 
 
105 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  74.04 
 
 
103 aa  152  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  69.23 
 
 
104 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  66.35 
 
 
104 aa  143  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  68.87 
 
 
104 aa  143  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.26 
 
 
111 aa  137  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  63.46 
 
 
104 aa  133  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  63.46 
 
 
104 aa  133  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  63.46 
 
 
104 aa  133  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  63.46 
 
 
104 aa  133  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  63.46 
 
 
104 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  63.11 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  62.5 
 
 
104 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  62.14 
 
 
104 aa  129  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  62.14 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  62.14 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  62.14 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  56.48 
 
 
108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.34 
 
 
105 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  51.79 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.79 
 
 
119 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.79 
 
 
114 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  51.4 
 
 
107 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 
114 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  51.4 
 
 
135 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.47 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.28 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.94 
 
 
111 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.41 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.41 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.52 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  59.15 
 
 
114 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  59.15 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0418  flagellar hook-basal body complex protein  59.7 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0984144  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3282  flagellar hook-basal body complex protein FliE, putative  59.7 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.556445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2947  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  59.7 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2141  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  59.7 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0223  flagellar hook-basal body complex protein FliE  59.7 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  59.7 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3399  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  59.7 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  46.34 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  45.05 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  42.06 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  37.39 
 
 
115 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  46.67 
 
 
105 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  43.3 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  42.59 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  45.57 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.39 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  45.57 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  42.59 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  42.59 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  43.43 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  43.43 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  38.32 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  42.27 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  43.75 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  39.81 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  36.08 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  38.61 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.19 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  44.71 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  39.25 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  38.61 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  35.05 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.09 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.32 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.15 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.59 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  35.78 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0090  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.78 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.48 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.76 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.76 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  37.35 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.65 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  33.65 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  38.89 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.48 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  36.99 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.16 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.03 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  40.79 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.26 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  36.62 
 
 
122 aa  57.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.43 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.43 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.07 
 
 
103 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.37 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.78 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  37.5 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.73 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>