170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2309 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  72.82 
 
 		 109 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  71.84 
 
 		 103 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  71.84 
 
 		 103 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  62.82 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  57.78 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.18 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  64.86 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.45 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  63.51 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  62.16 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  62.16 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  62.16 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  62.16 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  60.81 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.09 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.64 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  60.81 
 
 		 110 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  52.58 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  60.27 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  51.55 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.52 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.45 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.14 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  50.52 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.95 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  45.83 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  49.48 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  49.48 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  54.05 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.59 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.71 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  48.31 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  54.93 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  53.52 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  43.88 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  43.88 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  53.52 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  43.88 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  43.88 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  38.32 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.98 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.7 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  46.25 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.44 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  37.04 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  45.83 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.21 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  40.4 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  38.61 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.83 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  40.74 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.37 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.21 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  38.61 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.21 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.63 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.79 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  37.62 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  36.89 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  36.89 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  36.89 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.66 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  40.85 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  33.64 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  35.51 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.64 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.53 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.1 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.75 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.23 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  35.53 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.78 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.78 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  34.12 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.51 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  34.12 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.78 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  35.24 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.78 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.25 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  32.89 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  32.89 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.53 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.84 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.67 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.41 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  33.66 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  33.66 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.654615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>