156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4167 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
105 aa  210  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  60 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  56.6 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  55.66 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.77 
 
 
104 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  60.58 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  54.81 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.38 
 
 
111 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.46 
 
 
119 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.46 
 
 
114 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.09 
 
 
111 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  54.72 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.38 
 
 
135 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  56.19 
 
 
103 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  49.54 
 
 
119 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  56.19 
 
 
105 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  56.19 
 
 
103 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.89 
 
 
104 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  51.89 
 
 
104 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  51.89 
 
 
104 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  51.89 
 
 
104 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  51.89 
 
 
104 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  49.54 
 
 
114 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  50.94 
 
 
104 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  51.43 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  57.33 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  49.02 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.14 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.14 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  56.94 
 
 
114 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.71 
 
 
114 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3282  flagellar hook-basal body complex protein FliE, putative  60 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.556445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2947  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  60 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2141  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  60 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0223  flagellar hook-basal body complex protein FliE  60 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  60 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3399  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  60 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0418  flagellar hook-basal body complex protein  60 
 
 
175 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0984144  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
115 aa  84.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  46.73 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.45 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  39.62 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  39.62 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  44.87 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  44.87 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  36.52 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  41.77 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.82 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  38.6 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.82 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.88 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.22 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
103 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.71 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  43.01 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  40.95 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.78 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.19 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  43.66 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  33 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.74 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.74 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0090  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.32 
 
 
116 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  41.05 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  41.94 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.37 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  38.14 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.73 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  42.17 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.65 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  37.66 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  31.73 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0106  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.67 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.36 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  33.33 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.95 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  32.67 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  33.65 
 
 
103 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  40.86 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.73 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  33.8 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  35.63 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.06 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.24 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2673  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>