195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2298 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  77.48 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  77.48 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  76.58 
 
 		 111 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  76.58 
 
 		 111 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  74.77 
 
 		 111 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  77.48 
 
 		 110 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  74.34 
 
 		 113 aa  167  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  74.11 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  74.34 
 
 		 113 aa  166  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  73.21 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  73.21 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  72.07 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  71.17 
 
 		 110 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  71.17 
 
 		 110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  52.04 
 
 		 109 aa  105  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  62.82 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  60.26 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  61.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.13 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  45.13 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.41 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  54.22 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.26 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  46.51 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  57.75 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  43.27 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  44.12 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  42.31 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  50.7 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  45.88 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  49.3 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.71 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.42 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  52.11 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  52.11 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  52.11 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  50.7 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.22 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.12 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  45.95 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  39.05 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.11 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.11 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  43.21 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.2 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.04 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.31 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  47.83 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  41.57 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.89 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  36.36 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.19 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.06 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.05 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  40.28 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  40.28 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  33.7 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.3 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.44 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.56 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.56 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  38.46 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.21 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.16 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.67 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.78 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.78 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.44 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  41.11 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.82 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.63 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0863696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>