165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1640 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  77.57 
 
 
107 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  76.64 
 
 
107 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  47.95 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  44.71 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.71 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  41.86 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  42.71 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.84 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  41.86 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.65 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  38.2 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.04 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.36 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.29 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.66 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.44 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.96 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  40.28 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  34.26 
 
 
104 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.73 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  40.54 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  41.77 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.62 
 
 
118 aa  57.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.85 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.79 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.05 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  33.64 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  42.25 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.29 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.29 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  32.65 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  35.21 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  34.82 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  34.26 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  43.06 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  43.06 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  40.54 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.16 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  33.93 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.8 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.93 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  33.93 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  33.93 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  32.41 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  33.93 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  34.26 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  34.57 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  36.11 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  35.21 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.85 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  32.58 
 
 
110 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 
103 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.04 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
98 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  36.04 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.08 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  36.04 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  32.71 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  32.71 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  32.71 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  36.04 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3282  flagellar hook-basal body complex protein FliE, putative  40.3 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.556445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2947  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.3 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2141  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.3 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0223  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.3 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.3 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3399  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.3 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0418  flagellar hook-basal body complex protein  40.3 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0984144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.19 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.35 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.29 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  32.71 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.58 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  30.38 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>