202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4743 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  77.27 
 
 
110 aa  168  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  80.18 
 
 
111 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  80.18 
 
 
111 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  45.22 
 
 
115 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.94 
 
 
135 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.14 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  51.16 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.1 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  53.73 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  53.16 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  53.52 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.52 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.52 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.52 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0418  flagellar hook-basal body complex protein  55.22 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0984144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  47.56 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3282  flagellar hook-basal body complex protein FliE, putative  55.22 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.556445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  38.71 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2947  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.22 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2141  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.22 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0223  flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.22 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.22 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3399  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.22 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.64 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  45.45 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  53.73 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.95 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  37.25 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  46.34 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.19 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.28 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  43.43 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  40.62 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.32 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.58 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.33 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  46.75 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.33 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.1 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.1 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.78 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.19 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  38.1 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  37.5 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  38.1 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  38.1 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  40.48 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  40.96 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  40.96 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  40.96 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.08 
 
 
102 aa  66.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  40.48 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  40.79 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  40.79 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  40.79 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  40.79 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.92 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  39.24 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  42.25 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.11 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.34 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.96 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.77 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  37.97 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.19 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  35.63 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  39.44 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.28 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  40.28 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.28 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.38 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.41 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.95 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>