187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2577 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  95.5 
 
 
111 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  94.59 
 
 
111 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  94.59 
 
 
111 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  93.69 
 
 
111 aa  213  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  91.96 
 
 
112 aa  209  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  93.75 
 
 
112 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  93.75 
 
 
112 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  92.86 
 
 
112 aa  207  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  82.3 
 
 
113 aa  185  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  81.08 
 
 
110 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  78.76 
 
 
113 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  74.77 
 
 
111 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  79.28 
 
 
110 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  74.77 
 
 
110 aa  166  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  74.77 
 
 
110 aa  164  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  67.57 
 
 
109 aa  110  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  63.51 
 
 
103 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  63.51 
 
 
103 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  63.51 
 
 
103 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.61 
 
 
113 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  44.25 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.37 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.84 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  41.18 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  56.34 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  49.37 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.71 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  53.52 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  53.95 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.09 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  45.45 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.16 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  48.1 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  52.11 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  50.7 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  52.11 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  50.7 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  50.7 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.7 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  50.7 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.44 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.67 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  43.06 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  39.78 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  43.24 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.87 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.47 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.47 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  37.62 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.89 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.59 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  43.66 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  40.96 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  41.03 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.42 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.48 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.56 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.66 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.48 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  40.28 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  40.28 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2673  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
102 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.06 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.29 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.3 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  38.38 
 
 
114 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.66 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.51 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.19 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.73 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.38 
 
 
135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  33.33 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.44 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.56 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0090  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.73 
 
 
116 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.33 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.16 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.63 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.63 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.56 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0630  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.43 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.45 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.02 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.86 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515484  normal  0.151853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  39.73 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>