191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1157 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
109 aa  219  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  63.55 
 
 
105 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.75 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.37 
 
 
103 aa  94  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  52.94 
 
 
109 aa  90.9  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 
121 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.26 
 
 
111 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.55 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  50.59 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  42.2 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.35 
 
 
120 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  41.82 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  40.91 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.91 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.11 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.24 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  49.33 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.21 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.16 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  37.62 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.16 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.16 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  37.62 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  52.11 
 
 
114 aa  77  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.51 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.58 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.36 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.13 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.59 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.59 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.35 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.59 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  44.16 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.24 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  35.45 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  42.42 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  44.94 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  46.75 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  37.62 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.37 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  39.09 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  34.55 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  35.92 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.86 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  45.45 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  35.92 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  39.76 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  34.78 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.38 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  39.76 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  39.76 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.7 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  41.33 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.64 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  38.18 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.33 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.84 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  36.96 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.38 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.38 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.61 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  45.07 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.58 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  37.76 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.32 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.7 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.26 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.26 
 
 
105 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.62 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.26 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.45 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.03 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.75 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.03 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.69 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  35.45 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.78 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.11 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.45 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  35.45 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  39.19 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  35.45 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  35.45 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  39.19 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2947  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.27 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2141  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.27 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0223  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.27 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.27 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3399  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.27 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>