175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2937 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  100 
 
 
117 aa  236  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.37 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  50.68 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.68 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.29 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.31 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.39 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  41.18 
 
 
110 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.39 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.61 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.42 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.81 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  44.87 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  47.37 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  45.56 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  45.56 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  46.05 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.25 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.45 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  45.33 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  41.03 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  45 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.46 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.03 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.02 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  41.35 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.02 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.67 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.61 
 
 
106 aa  67  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  45.83 
 
 
103 aa  67  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.83 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.75 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.74 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  44.74 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  38.96 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.74 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.74 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.81 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.69 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  43.9 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.58 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.69 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  45.33 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.5 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  40.26 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.27 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.73 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.62 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.62 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4418  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.85 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.376569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.58 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  31.96 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.25 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.13 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.43 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.31 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.73 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.31 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3566  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.26 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.68 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.64 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  38.75 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  36.08 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.62 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  37.8 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.11 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  42.03 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  37.8 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  37.8 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.03 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.11 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.02 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  41.89 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  33.33 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0090  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.95 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.29 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.08 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.65 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>