159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1275 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
104 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
104 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
104 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  99.04 
 
 
104 aa  204  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  98.08 
 
 
104 aa  202  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  88.46 
 
 
104 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  87.5 
 
 
104 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  87.5 
 
 
104 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  87.5 
 
 
104 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  87.5 
 
 
104 aa  185  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  87.5 
 
 
104 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  79.61 
 
 
104 aa  164  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  62.14 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  61.17 
 
 
104 aa  126  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.17 
 
 
104 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  58.25 
 
 
104 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  56.86 
 
 
105 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  56.86 
 
 
103 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  56.86 
 
 
103 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.73 
 
 
111 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  54.44 
 
 
108 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  49.04 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  51.52 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  41.96 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.96 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.96 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.66 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.93 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.93 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.23 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.11 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  51.39 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3282  flagellar hook-basal body complex protein FliE, putative  52.24 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.556445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2947  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.24 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2141  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.24 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0223  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.24 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.24 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3399  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.24 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0418  flagellar hook-basal body complex protein  52.24 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0984144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.32 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  45.33 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  38.46 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  42.72 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  44.71 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  43.48 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  36.04 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0090  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.04 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  40.79 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  40.79 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  40.82 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  42.39 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  47.22 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  44.68 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.58 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.47 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  43.06 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.02 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  34.65 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  31.96 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.06 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  30.93 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  37.04 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.44 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.04 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.64 
 
 
120 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  31.18 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.57 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  33.66 
 
 
103 aa  53.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.33 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.37 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.38 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.03 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.38 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  40 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.91 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>