190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3048 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
113 aa  227  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  61.06 
 
 
122 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.31 
 
 
110 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.15 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  48.33 
 
 
113 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.67 
 
 
112 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.79 
 
 
110 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.79 
 
 
112 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.58 
 
 
112 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
110 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  49.58 
 
 
112 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.61 
 
 
111 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.17 
 
 
111 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.17 
 
 
111 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.25 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.13 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.5 
 
 
113 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.33 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  45.95 
 
 
109 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  44.14 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.7 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  52.7 
 
 
103 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  53.95 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  50.67 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  40 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  43.88 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.02 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  40.18 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.27 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  38.89 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.83 
 
 
120 aa  76.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.36 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  45.57 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  45.57 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.78 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  45.57 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.02 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  43.02 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.95 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.53 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.53 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  45.83 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  45.83 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.9 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  45.83 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.21 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.25 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.4 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.68 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.84 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.17 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.06 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.58 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  46.15 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  41.67 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  46.15 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.32 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.32 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  37.74 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.38 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  43.66 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.59 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.66 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  39.19 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.38 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.38 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.04 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.04 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.97 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  40.28 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.31 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  42.11 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  34.07 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  34.74 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.73 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.37 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  33.7 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>