182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1443 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  100 
 
 
110 aa  216  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  54.46 
 
 
109 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  54.46 
 
 
109 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  50.45 
 
 
109 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  51.33 
 
 
111 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.44 
 
 
118 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  48.65 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  46.85 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  46.85 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  45.95 
 
 
110 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  46.85 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.16 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.41 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  40.98 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.86 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.34 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  39.39 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.52 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.78 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.67 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  40.19 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.07 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  41.41 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.98 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  39.77 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  39.25 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.18 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.37 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  50 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.29 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.29 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.04 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.17 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.42 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.39 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  40.22 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.42 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.68 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.26 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.26 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.14 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.13 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.84 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  37.37 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.04 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.86 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.45 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  41.41 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  45.83 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.4 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.28 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0710  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.45 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  39.82 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.45 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515484  normal  0.151853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4418  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.77 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.376569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0630  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.53 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.39 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.19 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.95 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.67 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.24 
 
 
106 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  32.95 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.79 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  41.33 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  42.5 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.29 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  42.5 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0106  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.69 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.48 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.03 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.03 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  42.86 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.84 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.09 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.19 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.67 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.1 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  38.54 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>