205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3458 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
111 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  99.09 
 
 
118 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  82.57 
 
 
109 aa  184  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  83.64 
 
 
110 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  81.98 
 
 
110 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  78.9 
 
 
109 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  81.98 
 
 
110 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  81.98 
 
 
110 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  78.9 
 
 
109 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  77.06 
 
 
109 aa  167  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  51.33 
 
 
110 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.41 
 
 
122 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.28 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  45.71 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  42.15 
 
 
121 aa  94  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  51.55 
 
 
103 aa  92  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.74 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.42 
 
 
103 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  46.39 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  45.36 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.79 
 
 
106 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  54.55 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.88 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  47.62 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  50.68 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.28 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.25 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.22 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
110 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  48.65 
 
 
123 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  48.65 
 
 
123 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.7 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.32 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.11 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.88 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.11 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  48.15 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.11 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.67 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.11 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.02 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.43 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  43.75 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.87 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.71 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  40.62 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  40.62 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.3 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  42.99 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  42.99 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.62 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  49.3 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  54.17 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  43.53 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.75 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.67 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.98 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.98 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  45.88 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  39.8 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  47.3 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.53 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.75 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.34 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.34 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.3 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  43.75 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.19 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.95 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.12 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.23 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.75 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  43.75 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  43.75 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  48.65 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  43.75 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  43.75 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  45.07 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.61 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  45.07 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.05 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.53 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  39.25 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.78 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.61 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.78 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.74 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  50 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  53.12 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  38.32 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.78 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.71 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.95 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0418  flagellar hook-basal body complex protein  50 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0984144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>