185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1718 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
109 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  74.76 
 
 
103 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  73.79 
 
 
103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  72.82 
 
 
103 aa  160  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  57.01 
 
 
112 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.14 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.14 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  67.57 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.14 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  67.57 
 
 
111 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  67.57 
 
 
111 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  66.22 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  66.22 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  65.75 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  64.86 
 
 
113 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  52.04 
 
 
111 aa  105  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  60.81 
 
 
110 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  59.46 
 
 
113 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  59.46 
 
 
110 aa  100  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.79 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.76 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.96 
 
 
120 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.95 
 
 
113 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  54.05 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.94 
 
 
109 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  48.45 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  47.96 
 
 
109 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.83 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.16 
 
 
106 aa  87.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.42 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  46.39 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  46.39 
 
 
111 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  46.39 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  52.11 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  42.86 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  49.37 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.73 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.3 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  50.7 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  45.05 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  40.82 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  40.7 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  39.8 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  39.8 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  39.8 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.15 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.77 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  45.83 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.14 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  38.61 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.79 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.62 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  39.77 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.47 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.47 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  36.63 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  37.62 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.13 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.44 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.92 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  34.95 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  34.95 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  38.03 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  34.95 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  36.59 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.08 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  35.53 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.73 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  34.21 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  34.21 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.56 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  34.65 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  34.65 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  34.12 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  34.65 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  34.65 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  34.12 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  34.65 
 
 
104 aa  59.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  39.29 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  33.98 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.98 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  33.98 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  33.98 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  33.98 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
104 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.67 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.11 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.2 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.55 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  35.53 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.44 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.06 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>