205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1957 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  99.09 
 
 		 111 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  81.65 
 
 		 109 aa  184  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  82.73 
 
 		 110 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  81.08 
 
 		 110 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  77.98 
 
 		 109 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  81.08 
 
 		 110 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  81.08 
 
 		 110 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  77.98 
 
 		 109 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  76.15 
 
 		 109 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  50.44 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.27 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.41 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  44.76 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  41.32 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.86 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  50.52 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  47.42 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.39 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  44.33 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.86 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  54.55 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.71 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  46.43 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  49.32 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.13 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.32 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  53.73 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.88 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.19 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  48.65 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  48.65 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.65 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  48.15 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.33 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.38 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.38 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.7 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.7 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.7 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  41.76 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.43 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.02 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.7 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.71 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.79 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.59 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  52.78 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  42.06 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.89 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.38 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  42.06 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  42.06 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.45 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  44.71 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  43.53 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.56 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.83 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.56 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.83 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.53 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  38.78 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.33 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.95 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.5 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.95 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.19 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.34 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.37 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.2 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.37 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.61 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  43.66 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  47.3 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.61 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  43.66 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  42.59 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.53 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  38.32 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.61 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.56 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.56 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.74 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  50 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  51.56 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.7 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.29 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.58 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  41.89 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  37.38 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>