138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04972 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  100 
 
 		 118 aa  234  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  92.37 
 
 		 118 aa  219  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3566  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  60 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.19 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.08 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.67 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4418  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  66.67 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.376569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0630  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.94 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.94 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515484  normal  0.151853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0710  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.94 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3383  flagellar hook-basal body complex protein FliE  56 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.409901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.52 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0249  lateral flagellar basal body component protein LfiE  58.33 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  51.39 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.5 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0222  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.21 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  50.67 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  48.68 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0170  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.86 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45.71 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.74 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.91 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  36.59 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.91 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.91 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.91 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  41.1 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.59 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.86 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.25 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.47 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.61 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  44 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  43.06 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.7 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  43.06 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  38.67 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.89 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.11 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.91 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.11 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.51 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.07 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.62 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.38 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.04 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  41.1 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.08 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.08 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.19 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.51 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  38.89 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  37.21 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.68 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.22 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.35 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.88 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  33.66 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.5 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.57 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2992  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.94 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.36 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>